Крылов П.Н. Флора Алтая и Томской губернии. Томск. 1903-1914. Т. 1-7.
Крылов П.Н. Флора Западной Сибири. Томск. 1927-1962. Т. 1-12.
Сергиевская Л.П. Флора Забайкалья. Томск: Изд-во Том. ун-та, 1966-1972. Вып. 1-4
Флора Красноярского края / под ред. В.В. Ревердатто, Л.П. Сергиевской, А.В. Положий. Томск: Изд-во Том. ун-та, Новосибирск: Наука, 1960-1983. Т. 1-10.
Положий А.В. Систематика цветковых растений. Томск: Изд-во Том. ун-та, 1978. 247 с.
Положий А.В., Крапивкина Э.Д. Реликты третичных широколиственных лесов во флоре Сибири. Томск: Изд-во Том. ун-та, 1985. 156 с.
Положий А.В. Гербарий имени П.Н. Крылова в Томском университете (к 100-летию со времени основания). Томск: Изд-во Том. ун-та, 1986. 87 с.
Положий А.В., Балашова В.Ф. Типы таксонов в Гербарии им. П.Н. Крылова. Томск: Изд-во Том. ун-та, 1989. 47 с.
Курбатский В.И. Происхождение покрытосеменных (новые взгляды на решение проблемы). Томск: Изд-во Том. ун-та, 1993. 183 с.
Лекарственные растения Сибири / А.В. Положий, Е.Д. Гольдберг, И.И. Гуреева и др. Томск: Изд-во Том. ун-та, 1995. 324 с.
Флора Сибири. Rosaceae / А.В. Положий, С.Н. Выдрина, В.И. Курбатский. Новосибирск: Наука, 1988. Т. 8. 200 с.
Флора Сибири. Fabaceae (Leguminosae) / А.В. Положий, С.Н. Выдрина, В.И. Курбатский, О.Д. Никифорова. Новосибирск: Наука, 1994. Т. 9. 280 с.
Флора Сибири. Solanaceae – Lobeliaceae / А.В. Положий, С.Н. Выдрина, В.И. Курбатский, Е.Г. Наумова, М.В. Олонова. Новосибирск: Наука, 1996. Т. 12. 208 с.
С 2000 г. сотрудниками Гербария опубликовано 95 статей и более 6 тезисов докладов.
Аннотированный список основных работ, вышедших с 2000 г.
Монографии
Гуреева И.И. Равноспоровые папоротники Южной Сибири. Систематика, происхождение, биоморфология, популяционная биология. Томск: Изд-во Том. ун-та, 2001. 158 с.
Книга основана на многолетних исследованиях автора и обработке коллекций ведущих Гербариев России. Приведены результаты исследований по систематике, географии, экологии, биоморфологии и демографии популяций равноспоровых папоротников Южной Сибири. Книга содержит оригинальные иллюстрации по биоморфологии спорофитов папоротников, по онтогенезу гаметофитов и спорофитов.
Флора островных приенисейских степей. Сосудистые растения / А.В. Положий, И.И. Гуреева, В.И. Курбатский, С.Н. Выдрина, М.В. Олонова, Е.Г. Наумова. Томск: Изд-во Том. ун-та. 2002. 156 с.
На основе проведенных в последние годы исследований приводится современный таксономический состав сосудистых растений островных приенисейских степей с краткой характеристикой экологической приуроченности и географического распространения видов. Рассматриваются эндемичные и реликтовые элементы в составе флоры. Выдвигаются представления об источниках и путях формирования степной флоры на юге приенисейской Сибири.
Доронькин В.М., Положий А.В., Курбатский В.И., Выдрина С.Н., Лукманова Л.З. Флора Сибири. Т. 14. Дополнения и исправления. Новосибирск: Наука, 2003. 187 с.
Завершающий том коллективной сводки по систематике и хорологии сосудистых растений Сибири. В него вошли новые сведения по номенклатуре и распространению видов, которые появились после выхода в свет соответствующих томов или были пропущены
Polozhiy A.V., Vydrina S.N., Kurbatskiy V.I. Flora of Siberia: Rosaceae (L.I. Malyschev Ed.-in-Chief). 2004. Vol. 8. 208 p.
Переиздание на английском языке 8 тома Флоры Сибири, включающего сем. Rosaceae.
Polozhij A.V., Vydrina S.N., Kurbatsky V.I. Flora of Siberia. Volume 9. Fabaceae (Leguminosae) (series editors A.V. Polozhij and L.I. Malyshev). Enfield (NH)/Jersey/Plymouth: Science publishers, 2006. 276 p.
Переиздание на английском языке 9 тома Флоры Сибири, включающего сем. Fabaceae
Polozhij A.V., Vydrina S.N., Kurbatsky V.I. Flora of Siberia. Vol. 12. Solanaceae - Lobeliaceae. Enfield (NH)/Jersey/Plymouth: Science publishers, 2007. 221 p.
Переиздание на английском языке 12 тома Флоры Сибири, включающего сем-ва Solanaceae, Scrophulariaceae, Orobanchaceae, Lentibulariaceae, Plantaginaceae, Rubiaceae, Caprifoliaceae, Adoxaceae, Valerianaceae, Dipsacaceae, Cucurbitaceae, Campanulaceae, Lobeliaceae
Doronkin V.M., Polozhij A.V., Kurbatsky V.I., Vydrina S.N. et al. Flora of Siberia. Vol. 14. Additions and Corrections. Enfield (NH)/Jersey/Plymouth: Science publishers, 2008. 210 p.
Переиздание на английском языке 14 тома Флоры Сибири, включающего дополнения и исправления к Флоре Сибири и алфавитные указатели.
Учебники
Положий А.В. Систематика цветковых растений. Учебник для биологических факультетов вузов. Томск: Редакционно-издательский отдел Том. ун-та, 2001. 319 с.
В учебнике дана общая характеристика цветковых растений, рассматриваются теоретические вопросы эволюционной систематики. Обсуждаются проблемы происхождения цветковых растений и их морфологической эволюции. Дается краткий обзор систем цветковых растений. В специальной части рассмотрены основные таксоны по системе А.Л. Тахтаджяна.
Положий А.В., Гуреева И.И. Высшие растения: Анатомия, морфология, систематика. Учебное пособие для вузов. Томск: Томский гос. ун-т, 2004. 187 с.
Учебное пособие содержит краткий сведения по анатомии, морфологии и систематике сосудистых растений, включая строение растительной клетки, характеристику тканей и органов растений, описание существующих филогенетических систем цветковых растений и характеристику основных отделов и семейств высших растений.
Сборники
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2000. Вып. 91. 32 c.
Курбатский В.И., Гуреева И.И. О некоторых флористических находках в степях Хакасии
Олонова М.В. Новые таксоны мятлика (Poa L.) из Сибири
Пяк А.И. Заметка о видах рода Craniospermum Lehm. (Boraginaceae) на Алтае
Положий А.В. Эндемичные виды Oxytropis во флоре островных Приенисейских степей
Амельченко В.П. Новые находки сосудистых растений в Томской области
Олонова В.М. Морфологическое разнообразие Poa sibirica Roshev. (Poaceae) на территории Сибири
Курбатский В.И., Амельченко В.П. О распространении Plantago scabra Moenh в Сибири
Малахова Л.А., Амельченко В.П. Изучение природных популяций купен в Томской области.
Беляева Т.Н. Морфология семян видов Paeonia L.
Ханина М.А., Серых Е.А. анатомические особенности полыней родства Artemisia Ledeb.
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2000. Вып. 92. 31 c.
Олонова М.В. Морфометрическое исследование секций рода Poa L.
Гуреева И.И. О видах родства Athyrium filix-femina (L.) Roth. в Южной Сибири
Пяк А.И., Ревушкин А.С. Новый вид рода Olgaea Iljin из секции Apteron Iljin.
Положий А.В. Род Oxytropis DC. во флоре островных приенисейских степей
Курбатский В.И. Дополнение к флоре юга Красноярского края.
Пяк А.И., Эбель А.Л. Новый вид рода Hedysarum из Горного Алтая.
Амельченко А.П. О взаимоотношениях полыней родства Heterophyllae Krasch.
Эбель А.Л. Hippochaete ramosissima (Desf.) Boern. И Y. X moorei (Newm.) H/P/ Fuchs (Equisetaceae) – редкие виды флоры Сибири.
Олонова М.В. О Poa smirnovii Roshev. и Poa arctica R.Br. на территории Сибири.
Тимошок Е.Е. Морфологическое разнообразие Vaccinium vitis-idaea L. на Западно-Сибирской равнине в Горном Алтае и Кузнецком Алатау.
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2003. Вып. 93. 31 c.
Положий А.В. Близкие с Кавказской Potentilla agrimonioides Bieb. Виды во флоре Сибири
Курбатский В.И. К распространению Betula pseudomiddendorffii V.Vassil. на территории республики Хакасия
Олонова М.В. К изучению видового комплекса Poa attenuata Trin – Poa botryoides Trin.
Олонова М.В. Новое местонахождение Poa compressa L.
Курбатский В.И., Малахова Л.А. Число хромосом для некоторых видов рода Hedysarum L. на юге Красноярского края (Минусинская степь)
Эбель А.Л. Дополнение к распространению некоторых видов крестоцветных в Хакасии.
Рудая Н.А. Об Astragalus politovii Kryl. и A. luxurans Bunge (Fabaceae) в Русском и Монгольском Алтае
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2004. Вып. 94. 22 c.
Гуреева И.И. Памяти Антонины Васильевны Положий (1917-2003)
Гуреева И.И., Тимошок Е.Е. Папоротники на моренных комплексах ледников Центрального Алтая
Олонова М.В. О Poa alpigena (Blytt.) Lindm. s.l. в Сибири
Эбель А.Л. О распространении видов Polygonaceae Juss. в Хакасии
Гуреева И.И., Балашова В.Ф. Типовые образцы цветковых растений из коллекции Г.С.Карелина и И.П.Кирилова, хранящиеся в Гербарии им. П.Н.Крылова (ТК) Томского государственного университета
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2005. Вып. 95. 45 c.
Гуреева И.И. К 120-летию основания Гербария в Томском университете
Курбатский В.И. Анатомическое строение перикарпия и семенной кожуры сибирских представителей Potentilla L., Dasiphora Raf. и Comarum L. и его значение для систематики и филогении
Гуреева И.И., Пейдж К.Н. К вопросу о систематическом положенииорляка в Сибири
Олонова М.В. К изучению Poa reverdattoi Roshev. и P. argunensis Roshev
Пяк А.И. Anthyllis arenaria (Rupr.) Juz. – новый адвентивный род и вид флоры Сибири
Соренг Р.Дж., Олонова М.В. О распространении редкого вида Poa veresczaginii Tzvel
Курбатский В.И. Дополнение к флоре Республики Хакасия
Амельченко В.П. Род Artemisia L. (Asteraceae) в Хакасии
Прокопьев А.С., Беляева Т.Н., Бляхарчук Т.А. Морфологические особенности пыльцевых зерен видов рода Sedum L.
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2006. Вып. 96. 24 c.
Пяк А.И. О видах рода Lagopsis Bunge на Алтае
Пяк А.И., Щеголева Н.В. Новый вид рода Ranunculus L. из Юго-Восточного Алтая
Щеголева Н.В. Новый вид рода Ranunculus L. из Северо-Западной Монголии
Эбель А.Л. Новые таксоны рода Delphinium (Ranunculaceae) с Алтая
Бытотова С.В. Новые местонахождения редких видов Fabaceae во флоре Абаканской степи
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2006. Вып. 97. 33 c.
Эбель А.Л. О некоторых редких видах растений во флоре юга Средней Сибири
Олонова М.В. К изучению комплекса Pоа glauca Wahl. Алтае-Саянской горной страны
Кузнецов А.А., Гуреева И.И. Морфология спор сибирских видов Woodsia R.Br.
Щеголева Н.В. Новый таксон рода Ranunculus L. (Ranunculaceae)
Герман Д.А. Об эндемичном виде Erysimum transiliense M. Pop. (Cruciferae)
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2007. Вып. 98. 36 c.
Гуреева И.И. К 110-летию со дня рождения Л.П. Сергиевской, 90-летию со дня рождения А.В. Положий и 90-летию образования Томского отделения Русского Ботанического общества
Курбатский В.И., Масленникова А.В. Новые и редкие растения для флоры Республики Хакасия с территории Западного Саяна
Эбель А.Л. Новый вид рода Delphinium L. (Ranunculaceae) из Южной Сибири
Щёголева Н.В. К таксономии центральноазиатских представителей рода Ranunculus L. (Ranunculaceae)
Тимошок Е.Е., Райская Ю.Г., Скороходов С.Н. Новинки для флоры государственного природного заповедника «Тунгусский» и междуречья Подкаменной Тунгуски и Чуни
Бытотова С.В. Новые местонахождения эндемичного вида Ptilagrostis minutiflora (Titov ex Roshev.) Czer. (Poaceae)
Курбатский В.И. Реликтовые элементы во флоре Республики Хакасия
Бытотова С.В. О распространении эндемика Хакасии Oxytropis reverdattoi Jurtz. (Fabaceae)
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2008. Вып. 99. 34 c.
Курбатский В.И. К внутриродовой систематике Potentilla L. и Comarum L. s.l.
Луферов А.Н. Материалы к таксономии и хорологии Delphinium retropilosum (Ranunculaceae)
Эбель А.Л., Яковлева Г.И., Манаков Ю.А. Erucastrum gallicum (Brassicaceae) – новый для Сибири адвентивный вид
Олонова М.В., Пулькина С.В., Чен В.-Л. К изучению мятликов комплекса Pоа versicolor Веss. (Роасеае) в Северном Китае
Эбель Т.В., Эбель А.Л. Заметки по осоковым (Cyperaceae) юга Западной и Средней Сибири
Систематические заметки по материалам Гербария им. П.Н.Крылова при Томском государственном университете. Томск, 2008. Вып. 100. 37 c.
Гуреева И.И. К выходу 100-го выпуска «Систематических заметок»
Гуреева И.И., Балашова В.Ф. Типовые образцы сем. Poaceae в Гербарии им. П.Н. Крылова (ТК)
Щёголева Н.В. Систематический строй рода Ranunculus L. Алтае-Саянской флористической провинции Герман Д.А. Что такое Ermania saposhnikovii (Cruciferae)?
Тимошок Е.Е., Райская Ю.Г., Скороходов С.Н. Новые виды во флоре государственного природного заповедника «Тунгусский» и междуречья Подкаменной Тунгуски и Чуни
Труды первой Российской птеридологической конференции и школы-семинара по птеридологии (Томск-Барнаул, 20-30 августа 2007 г.) / под ред. И.И. Гуреевой. Томск: Изд-во Том. ун-та, 2007. 186 с.
Сборник содержит статьи и краткие сообщения, посвященные систематике, разнообразию, экологии, биоморфологии, популяционной биологии сосудистых споровых растений – папоротников, хвощей, плаунов.